В МАУ СШ «Приморец» НГО представлена линейная структура управления.

Такой тип организационной структуры более целесообразен для учреждения и имеет ряд преимуществ:

- четкая система взаимных связей,

- быстрота реакции в ответ на прямые приказания,

- согласованность действий исполнителей,

- оперативность в принятии решений,

- ясно выраженная личная ответственность руководителя (любого уровня) за принятые решения.

В учреждении действуют коллегиальные органы управления:

- Тренерский совет 

- Общее собрание трудового коллектива 

Руководители структурных подразделений:

Директор учреждения: Володина Оксана Александровна

Заместитель директора по Спортивной Работе: Конюхов Анатолий Александрович

Заместитель директора по АХЧ: Коноплев Дмитрий Сергеевич

Специалист по кадрам: Потафеева Людмила Александровна

Главный бухгалтер: Стожарова Анна Васильевна